Fu costruita negli anni 1552-1557 con il consenso del ré Sigismondo Augusto e con il sostegno della famiglia Kościelecki. Fu distrutto e ricostruito parecchie volte. Dal 1860 svolgeva la funzione di chiesa di guarnigione dell’esercito prussiano, poi anche di quello polacco. È la chiesa in cui possiamo ammirare le più vecchie policromie di Bydgoszcz (del XVII sec.), un pulpito in stile rococò e delle volte interessanti. Accanto alla chiesa ci sono gli edifici dell'ex monastero dei bernardini, ora di proprietà dell'Università di Tecnologia ed Industria.