Inizialmente veniva percorso dal cosiddetto Treno Papale, da Cracovia a Wadowice. Attualmente sia il sentiero che il treno vengono utilizzati solo occasionalmente.
Il 31 maggio 2006 è stata ufficialmente inaugurata a Cracovia la linea di 59 km "Ferrovia Giovanni Paolo II". È stato così introdotto il "Treno Papale" che trasportava i pellegrini dalla capitale della regione Malopolska a Wadowice. Durante il tragitto si fermava alle seguenti stazioni:
1. Kraków Płaszów - nelle vicinanze si trova il museo del campo di concentramento di Płaszów, il cui comandante era uno dei più grandi criminali nazisti, Amon Göth.
Con il tempo è stato costruito un nuovo collegamento ferroviario, che consente l'uscita a sud-ovest, senza passare per la stazione di Płaszów.
2. Kraków Łagiewniki - il Santuario della Divina Misericordia è stato consacrato da Giovanni Paolo II durante il suo ultimo pellegrinaggio in Polonia nel 2002. Qui il treno è stato benedetto da Papa Benedetto XVI durante la sua visita in Polonia.
3. Kalwaria Zebrzydowska - Lanckorona - il Santuario Mariano della Passione a Kalwaria Zebrzydowska è un importante centro della cultura mariana in Polonia, con il quale Karol Wojtyła è stato associato fin dall'infanzia. Oltre alla chiesa con l'immagine della Madonna dei Miracoli, esiste anche un complesso di chiese e cappelle noto come la Via Dolorosa polacca. Ogni anno, durante la Settimana Santa, si celebrano i tradizionali Misteri della Passione del Signore.
Inoltre, è capitato in alcuni giorni che il treno attraversasse Bielsko-Biała fino ad arrivare a Žilina.
Il veicolo EN61-01 dall'esterno si distingueva per la sua originale verniciatura dorata, mentre all'interno era dotato di comodi sedili con rivestimento giallo, braccioli e poggiatesta profilati. Erano presenti anche dei tavoli sotto le finestre. Inoltre, il treno era dotato di un servizio igienico adeguato alle esigenze dei disabili. In più, all'interno erano presenti monitor per la visualizzazione di presentazioni multimediali su Papa Giovanni Paolo II, oltre a cuffie per l'ascolto del lettore in varie lingue.
Dopo la chiusura del progetto, il sentiero continua ad essere utilizzato raramente, soltanto per vari eventi, così come anche il treno dorato dei Papi viene utilizzato solo occasionalmente. Non ci sono più treni che effettuano il servizio giornaliero tra Cracovia e Wadowice.
